يعتبر أهم ما يميز مركز جراحة الجهاز الهضمي أنه يضم معمل يحتوي على أحدث أجهزة التحاليل الطبية ويضم مهارات وكوادر بشرية من أساتذة جامعة المنصورة
وينقسم قسم المعامل إلى ستة أقسام رئيسية:

1) المعمل الرئيسي ويحتوي علي التحاليل التالية:

( أ ) الكيمياء الإكلينيكية ويشمل تحاليل وظائف الكبد والكلي والسكر و الإنزيمات
وتحاليل الكيمياء المختلفة ودلالات الأورام وغازات الدم .
ويحتوي علي العديد من الأجهزة الحديثة مثل.
* Hetachi 902
* Cobas integra 800
* AVL blood gases analyzer
* Electrolyte analyzer

(ب) أمراض الدم ( الهيماتولوجي ) ويشمل تحاليل الدم المختلفة وعوامل النزف والتجلط وفح خلايا الدم والبذل النخاعي للوصول الي أدق النتائج لتشخيص الإمراض المختلفة.
ويحتوي علي أجهزة
* Sysmex
* Celldyne
* Coagulation analyzers (MCA 210)
* Heco
* Hb electrophoresis

(جـ) قسم السيرولوجي الاكلينيكية : ويقوم بتحاليل الفيروسات بانواعها المختلفة
ويحتوي علي أجهزة
* Axsym
* Elecsys 2010

(د) قسم خاص بتحاليل زرع الكبد ومتابعتها دوريا.
( هـ ) قسم خاص بتحليل الطفيليات ( البول والبراز ) .

(2) بنك الدم:
ويقوم باستقبال المتبرعين وعمل التحاليل اللازمة لهم وتوفير أكياس الدم للمرضى وعمل التوافقات اللازمة ويحتوى على الثلاجات الخاصه بحفظ الدم، وذلك للتحاليل الكمية والنوعية والفيروسات.

(3) معمل PCR:
يحتوي على أحدث أجهزة تحاليل الفيروسات الكمية والنوعية علي المستوى الدولي كما يضم مجموعة من أكفأ الكيميائيين والفنيين وذلك للوصول إلى أدق النتائج.
من أجهزة التحاليل PCR

* Thermal cycler
* Electrophoresis
* Cobas Amplicor

(4) معمل Flow cytometry:
وهو يقوم بدور البحث العلمي المعملي .

(5 ) معمل الميكروبيولوجي:
يقوم بالخدمات التالية :

• التشخيص الميكروبيولوجي للحالات المرضيه وذلك باجراء المزارع البكتيريه والفطريه لعينات المرضى المترددين على المركز (العياده الخارجيه - القسم الداخلي - العنايه المركزه)
• عزل البكتيريا المسببه للمرض من عينات المرضى مثل ( البول , البراز , الدم , سوائل الجسم المختلفه , الصديد , مسحات العين , مسحات الأذن , مسحات الجروح , مسحات الحلق , البصاق ,الخ )
• تعريف البكتيريا المعزوله من العينات المختلفه للمرضى وعمل اختبارات الحساسيه للعديد من المضادات الحيويه لاختيار النوع المناسب للمريض
• المتابعه الميكروبيولوجيه لحالات زراعه الكبد و المتبرعين قبل وبعد اجراء الجراحه
• اجراء عمليات مراقبة العدوى(Infection Control ) و ذلك باخذ مسحات و عينات من الأقسام المختلفه للمركز( غرف قسم العمليات , العنايه المركزه لزراعة الكبد , العنايه المركزة , القسم الداخلي , المطبخ , خزانات المياه )
• تسجيل النتائج الخاصه بالمعمل على شبكه المعلومات الدولية وذلك للاستفاده العلاجيه و البحثيه
• المشاركه في العديد من الابحاث العلميه التي تهدف الى تحسين وتطوير الخدمه العلاجيه للمرضى

  ويحتوى على أجهزة:
  *Viteck
  *Station
  *Anaerobic
  

قسم التسجيل : يقوم بتوفير نظام تسجيل لبيانات المرضى و التحاليل المطلوبه لهم و تسجيل النتائج على شبكه الدولية للمرضي.

السمات المميزة لمعمل الجهاز الهضمي:

1. يحتوى المعمل على نخبه من أفضل الكوادر البشرية تحت إشراف نخبه من أساتذة الجامعة برئاسة ا.د / نوال عبد الجليل .
2. يحتوى المعمل على نظام شبكة الربط الداخلية لنقل نتائج التحاليل المختلفة بين أقسام المركز لتوفير الوقت والجهد.
3. يتميز معمل الجهاز الهضمى بتوافر أحدث الأجهزة الخاصه بأنواع التحاليل المختلفة و المرتبطه بالشبكه الداخليه للمركز لسرعه و سهوله توفرا لنتائج .و تتميز الاجهزة بالتقنيه العاليه و التى تضمن دقه و كفاءة النتائج و سرعه توفيرها .
4. يوفر المعمل التحاليل اللازمة لحالات زراعة الكبد ومتابعتها الدورية :
   * حيث يتم تعين نسبه مثبطات المناعه لمرضى الزرع باستخدام جهاز IMX
   * يتم فصل مكونات الدم من المتبرعين(كرات دم حمراء- بلازما- صفائح)
   كل على حده حسب احتياج المريض ويستخدم فى ذلك جهاز trema
   والذى يتميزبتنقيه هذه المكونات من خلايا الدم البيضاء التى قد تضر بمريض الزرع.
   * يقوم باجراء الفحوصات الخاصه بمرضى زراعه الكبد وبمتبرعى الكبد لتحديد
   المتبرع المناسب والمتوافق مع المريض.ويتم أيضا متابعه المرضى بعد خروجهم من المستشفى بصفه دوريه .
5. يوفر المعمل التدريب الدورى للأطباء المقيمين و الفنين حديثى التخرج وطلبة كليات العلوم حديثى التخرج